Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms