Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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