Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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APOFQ13790 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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APOFQ13790 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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APOFQ13790 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOFQ13790 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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