Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms