Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms