Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN2BQ13224 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2BQ13224 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
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