Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC16Q13042 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms