Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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