Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HSPB3Q12988 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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