Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms