Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms