Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms