Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNG1Q06432 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms