Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms