Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms