Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms