Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ERCC6Q03468 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms