Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms