Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms