Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms