Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNC1Q01954 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms