Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DEFA6Q01524 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms