Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms