Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms