Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms