Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCCQ00597 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms