Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKL1Q00532 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms