Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP2C1P98194 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP2C1P98194 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms