Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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