Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL8P80075 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL8P80075 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL8P80075 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL8P80075 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL8P80075 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL8P80075 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms