Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX1P78337 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX1P78337 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX1P78337 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX1P78337 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms