Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms