Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABP4P57796 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABP4P57796 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CABP4P57796 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABP4P57796 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABP4P57796 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABP4P57796 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABP4P57796 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABP4P57796 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABP4P57796 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABP4P57796 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABP4P57796 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms