Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PGGT1BP53609 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PGGT1BP53609 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PGGT1BP53609 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PGGT1BP53609 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PGGT1BP53609 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PGGT1BP53609 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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