Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CRIP1P50238 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms