Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA4P43694 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA4P43694 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms