Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTN2P35609 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms