Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms