Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCKSP29966 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms