Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PLNP26678 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PLNP26678 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PLNP26678 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PLNP26678 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms