Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms