Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms