Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRDP23468 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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