Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
S100A1P23297 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
S100A1P23297 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
S100A1P23297 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
S100A1P23297 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
S100A1P23297 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
S100A1P23297 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms