Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA6P23280 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA6P23280 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA6P23280 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA6P23280 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms