Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms