Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms