Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms