Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEFHP12036 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEFHP12036 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEFHP12036 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms