Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms